Флаг муниципального образования Северский район Краснодарского края составлен на основании герба Северского района по правилам и соответствующим традициям вексиллологии и отражает исторические, культурные, социально-экономические, национальные и иные местные традиции.
«Флаг Северского района представляет собой белое прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль верхнего и нижнего края голубую полосу, шириной в 1/7 ширины полотнища; в середине белой части воспроизведены фигуры из герба района в зёленом, жёлтом, белом, и красном цветах». Флаг Северского района разработан на основе герба, который языком символов и аллегорий отражает исторические и природно-географические особенности района.
Голубое полотнище вверху флага - символ чистого неба.
Голубое полотнище внизу флага - символ богатства района минеральными водами.
Зеленая усеченная пирамида - символизирует гору Собер-Оашх, имеющую вместо вершины огромную поляну, где совершались церковные службы.
Лев - символ силы, мужества и великодушия.
Желтый цвет - символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
Белый цвет - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Голубой цвет - символ чести, искренности, благородства.
Зеленый цвет - символ здоровья, природы, жизненного роста.
Авторская группа:
идея флага:
Михаил Шарунов (Краснодар),
Владимир Нагаевский (Тихорецк),
Василий Апанасенко (станица Северская, председатель Совета муниципального образования Северский район),
Анатолий Раков (Краснодар),
Константин Мочёнов (Химки);
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).
Утвержден решением Совета муниципального образования Северский район от 03.08.2006 г. № 351.
Внесен в Государственный Геральдический регистр Российской Федерации - № 2573.